Базы данных и основные инструменты биоинформатики

РАЗДЕЛ 1. ПОЯСНИТЕЛЬНАЯ ЗАПИСКА

1.1.  Требования к студентам.

Курс «Базы данных и основные инструменты биоинформатики» является принципиально важным для специальности «Биоинженерия и биоинформатика» и опирается на теоретические и практические знания, полученные студентами по дисциплинам математического и естественно-научного и профессионального циклов в течение первого года обучения. Для освоения данного курса необходимы базовые знания, которые студенты должны получить по химии, математике, информатике, клеточной биологии. Для успешного освоения дисциплины обязательным является владение знаниями о строении вещества, химических принципах существования материального мира, зависимости свойств химических соединений от их строения, особенностях существования живых организмов, строения и функций клеток, принципов научного познания, научной этики и биоэтики, принципов и инструментах моделирования поведения сложных систем, основ прикладной информатики.

1.2.  Краткая характеристика дисциплины.

Курс «Базы данных и основные инструменты биоинформатики» входит в модуль биоинформатики базовой части профессионального цикла дисциплин по специальности «Биоинженерия и биоинформатика».

Курс «Базы данных и основные инструменты биоинформатики» формирует базовые представления о принципах, практических методах и инструментах поиска, обработки, анализа и использования больших объемов биологической и химической информации. Полученные представления являются одними из базовых для прикладного использования достижений биоинформатики в практической деятельности человека.

1.3.  Учебные задачи дисциплины

В результате изучения дисциплины студент должен овладеть следующими компетенциями:

– способен представить современную картину мира на основе целостной системы естественно-научных и математических знаний, ориентироваться в ценностях бытия, жизни, культуры (ОК-1);

– способность грамотно и самостоятельно проводить теоретическую и экспериментальную научно-исследовательскую работу в области биоинженерии, биоинформатики и смежных дисциплин, а также оформлять ее в письменной форме, излагать в устной форме, и участвовать в различных формах дискуссий (ПК-1);

– способность самостоятельно приобретать с помощью информационных технологий и использовать в практической деятельности новые знания и умения в области биоинженерии, биоинформатики и смежных дисциплин (ПК-5);

– способность создавать новые программные средства и базы данных, а также использовать ресурсы Интернет (ПК-6);

– способность на научной основе организовать свой труд, владение методами сбора, хранения систематизации и обработки информации, в том числе статистическими и компьютерными методами, применяемыми в сфере его профессиональной деятельности (ПК-8);

– знать распорядительные документы, методические и нормативные материалы в области своей профессиональной деятельности и уметь их использовать при организации и планировании работ по специальности (ПК - 9);

– способность к приобретению новых знаний, используя современные информационные образовательные технологии, и готовность к изменению вида и характера своей профессиональной деятельности (ПК-11);

– способность использовать основные биологические базы данных, в том числе содержащие геномную, структурную и другую информацию, в научно - исследовательской работе (ПК-13);

– владеть основными средствами анализа геномной, структурной и другой биологической информации (ПК-14);

– способность хорошо ориентироваться в основных проблемах и задачах биологии, физико-химической биологии, биоинженерии и биоинформатики и использовать эти знания в экспериментальной и теоретической деятельности (ПК-18);

– способность получать и грамотно использовать информацию, накопленную в базах данных по структуре геномов, белков и другой биологической информации (ПК-19);

– способность использовать основные физико-химические и информационные методы исследования, применяемые в области физико-химической биологии, биоинженерии и биоинформатики (ПК-23);

– способность использовать специализированные знания фундаментальных разделов математики, физики, химии, экологии для проведения исследований в области биоинженерии, биоинформатики и смежных дисциплин (ПК-24).

1.4.  Формы работы студентов

Формами работы студентов являются лекции, лабораторные работы, выполнение модульных контрольных работ, контрольное тестирование, самостоятельная работа.

1.5. Виды контроля.

Текущий: контроль при выполнении лабораторных работ и итоговых протоколов, решение ситуационных зада (case-метод).

Промежуточный: контрольные работы по трем модулям, контрольное тестирование, подготовка докладов.

Итоговый: экзамен (3 семестр).

1.7. Методика формирования результирующей оценки

Учебным планом по данной дисциплине предусмотрен экзамен. Максимальное количество баллов, которое может набрать студент, 100.

За выполнение заданий текущего и промежуточного контроля студент может набрать максимальное количество баллов:

За первый модуль – 30 баллов.

За второй модуль – 30 баллов.

За третий модуль – 40 баллов.

Сумма баллов складывается следующим образом: полный ответ на семинарском занятии – 2 балла, дополнение на семинарском занятии – 1 балл, доклад на семинарском занятии – до 3-х баллов, проверочная работа на лекции – до 2-х баллов, модульная контрольная работа – 10 баллов.

При успешном освоении курса студент, набравший 60 баллов или более, может быть освобожден от зачета и получить оценку, в соответствии с количеством набранных им баллов.